Аска приєднується до класу Сіндзі в школі та переїжджає в квартиру Місато. Поки Аска пристосовується до Японії (точніше, всі інші пристосовуються до неї...), атакує новий Ангел, який здатний розділитися на дві ідентичні копії. EVA-01 і EVA-02 зазнають поразки, а NERV публічно принижена. Оскільки ангел перебуває в тижневому періоді регенерації після атаки N2 бомбою, Аска та Сіндзі повинні навчитися «синхронізувати» рухи один одного в бою, щоб перемогти його раз і назавжди.
